常熟境内河道密布,水上交通便利,有航道60条,通航里程533千米。常熟港于1996年11月8日经国务院批准正式对外籍船舶开放,属国家一类开放口岸。2000年11月末,常熟港跻身全国十大内河港。
常熟港拥有37.5千米长江岸线,已建有兴华码头、华润电力码头、常熟电厂码头、华润石化码头、益成码头、芬欧汇川纸业码头、常通汽渡码头等泊位21个,其中万吨级以上泊位11个,设计年吞吐能力1869万吨。常熟港水域建有锚地2个,其中常熟港公用过驳作业锚地,水域面积为3.48平方千米;常熟港海轮锚地,水域面积为3.36平方千米,设置锚位6个。常熟港集疏运条件。常熟港主要的内河水路通道有望虞河、常浒河、白茆塘等。